Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP4CP60510 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms