Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms