Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIK1P57059 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK1P57059 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK1P57059 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK1P57059 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK1P57059 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK1P57059 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK1P57059 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK1P57059 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK1P57059 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK1P57059 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK1P57059 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK1P57059 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK1P57059 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK1P57059 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK1P57059 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK1P57059 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIK1P57059 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIK1P57059 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SIK1P57059 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SIK1P57059 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIK1P57059 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIK1P57059 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms