Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP7P55210 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP7P55210 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP7P55210 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP7P55210 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP7P55210 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP7P55210 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP7P55210 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP7P55210 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP7P55210 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP7P55210 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP7P55210 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP7P55210 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP7P55210 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP7P55210 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP7P55210 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP7P55210 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP7P55210 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP7P55210 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP7P55210 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP7P55210 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP7P55210 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms