Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRPF1P55201 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRPF1P55201 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms