Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELLP55199 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELLP55199 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms