Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23BP54727 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms