Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNB3P54284 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms