Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A2P52657 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms