Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB28P51157 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB28P51157 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB28P51157 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB28P51157 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms