Protein–RNA interactions for Protein: P49910

ZNF165, Zinc finger protein 165, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF165P49910 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF165P49910 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF165P49910 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms