Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ME1P48163 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ME1P48163 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ME1P48163 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ME1P48163 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ME1P48163 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ME1P48163 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ME1P48163 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME1P48163 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME1P48163 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME1P48163 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME1P48163 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME1P48163 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME1P48163 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME1P48163 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME1P48163 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME1P48163 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME1P48163 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME1P48163 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME1P48163 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME1P48163 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME1P48163 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME1P48163 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ME1P48163 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME1P48163 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME1P48163 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME1P48163 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms