Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTRNP46939 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTRNP46939 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UTRNP46939 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UTRNP46939 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UTRNP46939 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UTRNP46939 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTRNP46939 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTRNP46939 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTRNP46939 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTRNP46939 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTRNP46939 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTRNP46939 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UTRNP46939 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTRNP46939 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTRNP46939 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTRNP46939 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UTRNP46939 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTRNP46939 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UTRNP46939 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UTRNP46939 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UTRNP46939 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
UTRNP46939 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UTRNP46939 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
UTRNP46939 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UTRNP46939 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UTRNP46939 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UTRNP46939 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UTRNP46939 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UTRNP46939 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UTRNP46939 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UTRNP46939 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms