Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCR1P46094 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCR1P46094 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCR1P46094 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCR1P46094 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCR1P46094 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCR1P46094 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCR1P46094 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCR1P46094 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCR1P46094 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCR1P46094 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XCR1P46094 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XCR1P46094 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
XCR1P46094 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XCR1P46094 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XCR1P46094 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XCR1P46094 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XCR1P46094 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XCR1P46094 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XCR1P46094 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XCR1P46094 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
XCR1P46094 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCR1P46094 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCR1P46094 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCR1P46094 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCR1P46094 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCR1P46094 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCR1P46094 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCR1P46094 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCR1P46094 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCR1P46094 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCR1P46094 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCR1P46094 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCR1P46094 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCR1P46094 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCR1P46094 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
XCR1P46094 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms