Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CEACAM6P40199 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM6P40199 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms