Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARGP37231 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARGP37231 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARGP37231 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARGP37231 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARGP37231 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARGP37231 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARGP37231 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARGP37231 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARGP37231 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms