Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJA4P35212 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA4P35212 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA4P35212 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA4P35212 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA4P35212 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA4P35212 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA4P35212 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA4P35212 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA4P35212 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA4P35212 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA4P35212 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA4P35212 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA4P35212 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJA4P35212 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GJA4P35212 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GJA4P35212 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJA4P35212 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms