Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCC1P33527 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ABCC1P33527 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms