Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A5P29400 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms