Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD10P28358 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXD10P28358 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD10P28358 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms