Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PEX2P28328 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PEX2P28328 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PEX2P28328 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX2P28328 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX2P28328 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX2P28328 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX2P28328 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX2P28328 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX2P28328 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PEX2P28328 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PEX2P28328 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms