Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTAFRP25105 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms