Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKACBP22694 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms