Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1BP22528 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms