Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TNNI3P19429 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms