Protein–RNA interactions for Protein: P18827

SDC1, Syndecan-1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC1P18827 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDC1P18827 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SDC1P18827 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SDC1P18827 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SDC1P18827 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SDC1P18827 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms