Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XBP1P17861 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XBP1P17861 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XBP1P17861 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XBP1P17861 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XBP1P17861 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XBP1P17861 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XBP1P17861 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
XBP1P17861 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XBP1P17861 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XBP1P17861 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XBP1P17861 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XBP1P17861 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XBP1P17861 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XBP1P17861 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XBP1P17861 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XBP1P17861 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XBP1P17861 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XBP1P17861 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XBP1P17861 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XBP1P17861 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XBP1P17861 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XBP1P17861 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XBP1P17861 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XBP1P17861 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XBP1P17861 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XBP1P17861 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XBP1P17861 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XBP1P17861 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms