Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF3P17036 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms