Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CD46P15529 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CD46P15529 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CD46P15529 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CD46P15529 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CD46P15529 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms