Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB3P14651 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms