Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM27P14373 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM27P14373 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms