Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD8P13378 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD8P13378 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms