Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYL1P12980 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYL1P12980 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYL1P12980 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYL1P12980 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYL1P12980 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYL1P12980 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYL1P12980 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms