Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTN1P12814 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms