Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TOP2AP11388 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOP2AP11388 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOP2AP11388 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
TOP2AP11388 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOP2AP11388 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
TOP2AP11388 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
TOP2AP11388 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TOP2AP11388 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms