Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB1P11230 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms