Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD1P0DJD0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD1P0DJD0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms