Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFTA3P0C7M3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms