Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXB5P09067 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms