Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC4P09017 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms