Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPSAP08865 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPSAP08865 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPSAP08865 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPSAP08865 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPSAP08865 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
RPSAP08865 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPSAP08865 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPSAP08865 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms