Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRPRAP08240 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRPRAP08240 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms