Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms