Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SERPIND1P05546 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms