Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCCAP05165 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCCAP05165 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCCAP05165 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCCAP05165 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCCAP05165 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCCAP05165 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCAP05165 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCAP05165 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCAP05165 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCAP05165 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCAP05165 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCAP05165 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCAP05165 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCAP05165 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCAP05165 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCAP05165 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCAP05165 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCAP05165 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCCAP05165 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCCAP05165 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCCAP05165 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCAP05165 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCAP05165 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCAP05165 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCAP05165 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCAP05165 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCAP05165 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCAP05165 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCAP05165 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCAP05165 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCAP05165 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCAP05165 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCAP05165 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCCAP05165 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCAP05165 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCAP05165 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCAP05165 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCAP05165 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCAP05165 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCAP05165 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCAP05165 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCAP05165 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCAP05165 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCAP05165 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCAP05165 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCAP05165 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCAP05165 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCAP05165 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCAP05165 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCCAP05165 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCCAP05165 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCCAP05165 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCCAP05165 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCCAP05165 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCCAP05165 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms