Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCELO95171 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCELO95171 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCELO95171 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCELO95171 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCELO95171 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCELO95171 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCELO95171 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCELO95171 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCELO95171 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCELO95171 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCELO95171 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCELO95171 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCELO95171 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCELO95171 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCELO95171 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms