Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRMUO75648 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRMUO75648 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRMUO75648 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRMUO75648 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRMUO75648 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRMUO75648 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRMUO75648 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRMUO75648 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRMUO75648 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRMUO75648 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRMUO75648 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRMUO75648 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRMUO75648 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRMUO75648 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRMUO75648 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRMUO75648 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRMUO75648 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
TRMUO75648 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRMUO75648 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRMUO75648 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms