Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA4O75335 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA4O75335 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA4O75335 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA4O75335 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA4O75335 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA4O75335 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA4O75335 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA4O75335 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA4O75335 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA4O75335 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA4O75335 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA4O75335 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA4O75335 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA4O75335 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms