Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP2O75323 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms