Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms